- Лабораторија за планарне и МЕМС технологије
- Лабораторија за трансмитерски програм – одељење припреме и реализације производње
- Лабораторија за електронику и мерне инструменте
- Лабораторија за микроскопију атомских сила и спектроскопију
- Лабораторија за наночестице
- Лабораторија за плазмонику и хемијске сензоре
- Лабораторија за фотодетекторе
Све истраживачке лабораторије ЦМТ лоциране су на адреси Студентски трг 16/III, Београд