U Centru su teorijski i eksperimentalno istraživane različite uređene strukture za nanofotoniku. Prvi rad u Srbiji iz tematike fotonskih kristala potekao je iz Centra. Uvedeno je nekoliko novih fotonskih struktura, uklјučujući eksperimentalno izrađene gradijentne fotonske kristale za infracrvenu oblast. Jedan deo istraživanja posvećen je jednodimenzionalnim strukturama sa donorskim ili akceptorskim ugrađenim defektom. Takođe su eksperimentalno rađeni dvodimenzionalni nizovi submikrometarskih stubića kao gradivni blokovi za difrakcione optičke elemente i za gradijentne metamaterijale za infracrvenu oblast. Godine 1997. predložena je holografska metoda izrade trodimenzionalnih fotonskih kristala za optičku oblast i uvedena su razmatranja optičkog šuma kao ograničavajućeg faktora primenlјivosti mezoskopskih struktura za nanofotoniku.